6年的欧冠冠军。
2006-07赛季在赛季初埃托奥便受了重伤，经过手术后，经历了长达五个月的休养。2007-08赛季虽然巴塞罗那球队成绩不理想，只取得西甲第三名，但埃托奥仍然取得了十三个联赛入球。
2008-09年球季埃托奥在西甲联赛射入三十球，在欧冠决赛再次取得入球，协助球队以二比零击败曼联再次赢得冠军。最终协助巴塞罗那夺得西甲冠军、国王杯冠军和欧洲冠军联赛冠军，为巴塞罗那的三冠王立下汗马功劳。在巴塞罗那，萨穆埃尔·埃托奥·菲尔斯帮助球队夺取了三次西甲冠军、两次欧冠冠军，个人进球达到一百零八个，成为西甲历史上进球最多的非洲球员。
而此时国际米兰则对他发出了邀请，他也随之离开了西班牙，开始了意甲的旅程。
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